MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D11S-1 plasmid S57

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014629	T	6	6	19	24	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014629	ACA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014629	GAA	2	6	170	175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014629	GAAT	2	8	180	187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014629	AAT	2	6	192	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014629	TCGAT	2	10	230	239	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014629	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014629	T	8	8	2033	2040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014629	T	7	7	2065	2071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014629	TCC	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_014629	T	6	6	2122	2127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014629	TAT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014629	AGA	2	6	4553	4558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014629	A	6	6	4836	4841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014629	AGCG	2	8	4876	4883	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014629	TAG	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014629	TATAT	2	10	5510	5519	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014629	CCA	2	6	5576	5581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_014629	A	7	7	5596	5602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014629	CTG	2	6	7894	7899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014629	T	7	7	7900	7906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014629	GTT	2	6	7989	7994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014629	T	7	7	8022	8028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014629	CTTT	2	8	8083	8090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014629	AGA	2	6	8118	8123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014629	TCA	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014629	TAT	2	6	8719	8724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014629	TTATTT	2	12	8750	8761	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014629	AAAT	2	8	8766	8773	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014629	TAA	2	6	8812	8817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014629	AAC	2	6	8827	8832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014629	AC	3	6	8835	8840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014629	AAATAA	2	12	8906	8917	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014629	A	6	6	9003	9008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014629	GAT	2	6	9009	9014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014629	AC	3	6	10186	10191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014629	CTTTTT	2	12	10221	10232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014629	A	6	6	10308	10313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014629	AAGA	2	8	10318	10325	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014629	T	6	6	10330	10335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014629	A	7	7	10341	10347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014629	TAT	2	6	10366	10371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014629	AAG	2	6	10386	10391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014629	AAT	2	6	10617	10622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014629	GAT	2	6	10645	10650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014629	TA	3	6	10704	10709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014629	GTT	2	6	10718	10723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014629	A	6	6	10996	11001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014629	ATA	2	6	11021	11026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014629	T	7	7	11072	11078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014629	TAA	2	6	12300	12305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014629	TTA	2	6	12616	12621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014629	TAA	2	6	12634	12639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014629	TTG	2	6	12647	12652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014629	ATT	2	6	12694	12699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014629	A	7	7	13167	13173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014629	T	6	6	13204	13209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014629	GT	3	6	13210	13215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014629	TCC	2	6	13983	13988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014629	CT	3	6	19624	19629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014629	ATA	2	6	19663	19668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014629	A	6	6	19668	19673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014629	A	6	6	19681	19686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.